Omicron varyantı;Bilim adamları, Güney Afrika, Hong Kong ve Avrupa’da COVID-19‘a neden olan virüs olan SARS-CoV-2’nin yeni bir varyantı vakalarını tespit ettiler. Omicron varyantı (B.1.1.529), genomunun, virüsün konakçı hücreleri enfekte etmek için kullandığı spike proteininin önemli bir bölümünü kodlayan kısmında eşi görülmemiş sayıda mutasyona sahiptir. Bu, Omicron’un, birçoğu orijinal spike proteinine ve geçmiş enfeksiyonlara dayanan aşıların sağladığı bazı bağışıklık korumasından kaçabileceğini düşündürmektedir.
Omicron varyantı
16 Kasım 2021’de Güney Afrika’da günlük 136 COVID-19 vakası kaydedildi . 25 Kasım 2021’e kadar bu sayı 1.200’ün üzerine çıktı.
Bu vakaların %80’inden fazlası Johannesburg ve Pretoria’yı da içeren yoğun nüfuslu Gauteng eyaletindeydi.
Araştırmacılar, her enfeksiyonun neden olduğu ortalama yeni vaka sayısı olan R-değerinin bir bütün olarak Güney Afrika için 1.47 olduğunu tahmin ediyor .
R 1’den büyükse, bir salgın katlanarak büyüyecektir. Gauteng eyaletinde R, 1.93 idi.
Güney Afrika’nın Stellenbosch kentindeki Salgın Müdahale ve Yenilik Merkezi’ndeki (CERI) bilim adamları, bu endişe verici rakamlardan virüsün Omicron varyantı (B.1.1.529) olarak bilinen yeni bir çeşidinin sorumlu olduğuna inanıyor.
Pandemi sırasında Güney Afrika’da daha önce üç enfeksiyon zirvesi yaşandı, üçüncüsü Delta varyantı nedeniyle. En son dalgalanma, bilim adamları tarafından Omicron’un ilk tespiti ile çakışıyor.
Bilim adamları, Güney Afrika’da yaklaşık 100 doğrulanmış Omicron enfeksiyonu vakasını sıraladılar. Vakaların çoğu Gauteng’de.
Yeni varyant Botsvana ve Hong Kong’da da mevcut ve bilim adamları bunu Avrupa’da da doğruladı.
Güney Afrika’dan haber brifingi
Ph.D. Prof. Tulio de Oliveira, “Bugünün ana mesajı, savaşmak için düşmanı tanımanız gerektiğidir” dedi .
Varyantın genomunun “çok sıra dışı bir mutasyon takımyıldızı” içerdiğini söylemeye devam etti. Bunların birçoğunun ya virüsün bağışıklık sisteminden kaçmasına ya da bulaşıcılığını artırmasına yardımcı olduğu doğrulandı ya da tahmin edildi.
Virüsün tüm genomunda yaklaşık 50 mutasyon olduğunu ve yükselişini kodlayan kısımda 30’dan fazla mutasyon olduğunu söyledi. Bu, virüsün konak hücrelerini istila etmesine izin veren proteindir.
Reseptör bağlama alanı (RBD) olarak adlandırılan sivri uçun belirli bir kısmı, adı verilen bir reseptöre bağlanır. ACE2Güvenilir Kaynak insan hücrelerinin zarında.
Prof. Oliveira, yeni varyantın RBD’sinde istisnai olarak çok sayıda değişiklik olduğunu söyledi.
RBD’ye bağlanan antikorlar, virüsün hücrelere bulaşmasını önleyebilir. Bu nedenle, RBD, bağışıklık sistemini belirli protein dizilerine karşı antikor yapmaya teşvik eden COVID-19 aşıları için çok önemli bir hedeftir .
Prof. Oliveira, Beta varyantının genomunun RBD kısmında üç mutasyona sahip olduğunu ve Delta varyantının iki mutasyona sahip olduğunu söyledi. Ancak Avrupa Hastalık Önleme ve Kontrol Merkezi’ne göre Omicron’un orada 15 mutasyonu var.
Bilim adamları arasındaki endişe, mutasyonlara bağlı değişikliklerin, aşılama veya bir enfeksiyon sırasında virüsün daha eski bir varyantıyla karşılaşma yoluyla üretilen antikorların virüsü nötralize etmesini önleyebilmesidir.
Terapötik antikorlar
Richard Lessells, Ph.D. Afrika Sağlık ve Nüfus Araştırmaları Merkezi’nde görevli bir bulaşıcı hastalık uzmanı, haber brifingine Omicron’un genomunun nötralize edici antikorlara dirençle ilişkili birkaç mutasyona sahip olduğunu söyledi.
Bunlar, yalnızca aşılama veya doğal enfeksiyon yoluyla üretilen antikorları değil, aynı zamanda terapötik monoklonal antikorları da içerir.
Dr. Lessells, Omicron genomunun aynı zamanda konakçı hücrelere daha verimli giriş ve daha iyi aktarılabilirlik ile ilişkili bir dizi mutasyona sahip olduğunu söyledi.
Ek olarak, doğuştan gelen bağışıklık sistemi olarak bilinen, yeni karşılaşılan patojenlere karşı vücudun ilk savunma hattına dirençle ilişkili bir mutasyona sahiptir.
“Bütün bunlar, bu varyantın sadece daha verimli yayılmak için bulaşıcılığı arttırmakla kalmayıp, aynı zamanda bağışıklık sisteminin bazı kısımlarını ve bağışıklık sistemimizde sahip olduğumuz korumayı da aşabileceği konusunda bize bazı endişeler veriyor.” dedi.
Ancak mutasyonların birleşik etkisinin bilinmediğini vurguladı. Omicron’un önceki varyantlardan daha hafif semptomlara neden olma olasılığı bile vardır.
“Gerçekten ancak laboratuvarda yapılan çalışmaları yaparak bileceğiz […]. [T] şapka çalışması zaten devam ediyor ”diye ekledi.
Bir endişe çeşidi
26 Kasım 2021’de, Dünya Sağlık Örgütü (WHO)Güvenilir Kaynak B.1.1.529’u bir endişe türü olarak belirledi ve ona Omicron adını verdi (Yunan alfabesinin 15. harfi).
Önümüzdeki birkaç gün içinde, dünyanın dört bir yanındaki birçok ülke, Güney Afrika ülkelerinden dönen yolculara ek kısıtlamalar getirdi.
Bilim adamları daha sonra Avrupa’da Omicron varyantı ile birkaç enfeksiyon vakasını doğruladılar.
Daniel Griffin, Ph.D. New York City’deki Columbia Üniversitesi’nden bir virolog, Medical News Today’e Omicron varyantındaki değişiklik sayısının önceki SARS-CoV-2 varyantlarına kıyasla çok yüksek olduğunu söyledi.
Yeni varyantın, bağışıklık sistemi zayıf olan aşılanmamış bir bireyde evrimleşmiş olabileceğini tahmin ediyor. Bu, virüsün insan bağışıklık sistemine adaptasyonlar geliştirmesi için alışılmadık derecede uzun bir süre vermiş olurdu.
Dr. Griffin, “Dünyanın pek çok yerinde düşük aşılama kapsamına sahip olmaya devam ettiğimiz için, virüse milyonlarca kopya fırsatı vererek ve daha uygun varyantları seçme fırsatı verdiğimiz için, bu varyantın şimdi tanımlanıyor olması gerçekten şaşırtıcı değil” dedi. .
“Şu anda bu virüs hakkında sınırlı veriye sahibiz, ancak bazı spike protein değişikliklerine bakabiliriz ve bu virüs hakkında bildiklerimize dayanarak, bağışıklıktan kaçınma ve bu varyantın yerini alma potansiyelleri hakkında endişelenmek çok uygundur. Delta varyantı” diye ekledi.
Önümüzdeki birkaç hafta içinde, bilim adamlarının cevaplaması gereken kritik soruların şunlar olacağını söyledi:
- Farklı aşılar bu varyanta karşı ne kadar işe yarayacak?
- Yeniden enfeksiyon oranları üzerindeki etkisi ne olacak?
- Omicron zaten geniş çapta yayıldı mı?
- Delta varyantı ile karşılaştırıldığında Omicron’un nispi uygunluğu nedir?
Gelişmiş geçirgenlik
COVID-19 Genomics UK Konsorsiyumu direktörü ve Birleşik Krallık’taki Cambridge Üniversitesi’nde halk sağlığı ve mikrobiyoloji profesörü olan Sharon Peacock, Londra’daki Science Media Center’a Omicron’daki bazı değişikliklerin gelişmiş bulaşıcılık ile tutarlı olduğunu söyledi.
“Diğer varyantlarda bağışıklık kaçırma ile ilişkilendirilen mutasyonlar da mevcut” diye açıkladı.
“Fakat tespit edilen mutasyonların birçoğunun önemi ve bu mutasyonların kombinasyonu bilinmiyor.”
Mevcut aşıların Omicron’a karşı ne kadar koruma sağlayacağına dair şu anda herhangi bir veri bulunmadığını vurguladı.
“Bu arada aşılama hızla ilerlemeye devam etmeli” diye bitirdi.